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手机短信不在屏幕上方显示的原因可能有以下几点。
1、短信应用设置异常：进入短信应用程序的设置菜单，检查相关的显示设置是否正确。
2、通知管理受限：手机可能限制了短信应用的通知权限，导致短信来了不会显示在手机屏幕上方的通知栏，这时需要进入手机的设置或通知管理界面，检查短信应用的通知权限是否开启。
3、系统错误或缓存问题：有时候手机的系统错误或缓存问题也可能导致短信不在屏幕上方显示，可以尝试重启手机或者清除短信应用的缓存和数据，看是否能解决问题。
4、短信应用与系统不兼容：在某些情况下，使用的短信应用可能与当前的系统版本不完全兼容，导致短信无法正确显示，可以尝试升级短信应用或者更换其他短信应用。
5、手机硬件问题：虽然较为少见，但手机显示屏或相关硬件出现问题也可能导致短信无法正常显示，如果怀疑硬件问题，建议联系手机制造商或售后服务中心进行检修。
原因可能导致手机短信不在屏幕上方显示，可以根据具体情况进行排查和解决。